本研究的目的是探究感染非洲猪瘟的猪群其肠道微生物的特征。本研究收集了在同一时间段内的病猪和健康猪的新鲜粪便样本,并根据各类细菌的16S rDNA基因设计引物后,对收集到的粪便样本进行PCR检测。根据PCR检测结果,了解健康猪和病猪肠道菌群的特征,并对所检测到的肠道菌群按照门、属进行分类。
结果显示,健康猪的细菌α多样性指数显著高于病猪(p<0.05)。对检测到的各细菌按照门进行分类,健康猪和病猪的肠道中超过98.5%的优势菌群为厚壁菌门、螺旋杆菌门和拟杆菌门(表1)。相较于正常猪,病猪肠道内的厚壁菌门和拟杆菌门丰度下降,而螺旋杆菌门丰度上升极为显著(p< 0.01)。对各肠道细菌按属进行分类,病猪肠道的颤旋菌属、链球菌属和罗斯伯利亚属的相对丰度显著下降(p<0.05)。最值得注意的是非洲猪瘟发病猪肠道内的密螺旋体丰度显著增加(p<0.01)。
本研究说明非洲猪瘟可能改变猪体内优势菌的丰度,密螺旋体可能是导致非洲猪瘟临床症状的诱因之一。
表1 健康猪和病猪样本中各门类、各属类细菌的相对丰度