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10月17日，广东省科技大会在广州召开，会上表彰了2023年度广东省科学技术奖的获奖单位和个人。广东中芯种业科技有限公司与华南农业大学等单位共同完成的《瘦肉型种猪基因组育种技术与应用》获2023年度广东省科学进步奖一等奖，中芯种业董事长吴珍芳教授为成果第一完成人。
该成果针对我国瘦肉型猪的单头产肉量和养殖效率与发达国家还有较大差距等重大问题，聚焦种猪育种关键技术创新，自主建立瘦肉型种猪基因组育种技术体系，打破国外基因芯片技术垄断，并大规模应用于瘦肉型猪本土化选育。经第三方评价，成果总体达到国际先进水平，其中建立的基于低深度测序的猪基因组选择技术体系达到国际领先水平。
该成果鉴别出影响瘦肉型猪重要经济性状的系列分子标记，创新了猪多组学联合分析和基因型填充方法，为建立瘦肉型猪分子育种技术打下坚实基础。鉴别到35个影响猪生长、繁殖、肉质等性状的大效应分子标记并获得基因专利，建立了多基因聚合育种技术。率先建立了整合基因组及转录组先验信息的猪肉质、生长性状基因组预测方法，其中肉色预测准确性提高43.3%。构建了瘦肉型猪基因组填充数据库和SWIM开放服务平台，突破了不同基因分型数据难以合并使用的瓶颈，向行业提供了约19.3万头种猪基因组填充服务。
同时，还创新了高通量、低成本的基因组SNPs分型技术，创建了瘦肉型猪基因组育种技术体系，解决了基因芯片依赖进口的“卡脖子”技术难题。从引进基因芯片，到先后自主创建了简化基因组测序、固相芯片、液相芯片、低深度重测序四种基因组SNPs分型技术。获得我国首例采用基因组选择技术选育的杜洛克特级种公猪；率先创制出针对瘦肉型猪主要商业群体的专用芯片PorcineWENS55K和TargseqPorcine60K；国内外首创基于低深度测序的高通量、低成本种猪基因分型技术，引领了猪基因组育种技术迭代升级，成本比初期进口下降18.8倍。创建了基因组大数据遗传评估技术和基因组育种工程化技术体系，实现基因组精准选种与选配。
此外，基因组育种技术在瘦肉型猪本土化选育中应用，加快了种猪遗传改良进展，培育种猪新品种。构建了瘦肉型猪基因组选择参考群体9.5万头，建立了基因组育种技术标准化操作流程和开放共享平台，应用于12个瘦肉型猪专门化品系的本土化选育，实现了断奶前的早期选择。
该成果获授权发明专利48件、国家计算机软件著作权14件，发表高水平论文112篇，出版著作2部。获神农中华农业科技奖一等奖、全国农牧渔业丰收奖推广合作奖各1项。
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